ネオとアナリストの激しい対決、そして謎めいたスミスの登場が緊張感を高める中、追手から逃れるネオとトリニティーは手を取り合い、ビルの屋上から飛び降ります。その瞬間、仲間の船員たちは固唾を飲み、「ネオは飛べるのか？」と息をのむ展開に。